Accueil > Documentation > Genomique > Profil génétique du CRP

Profil génétique du CRP

samedi 30 novembre 2019 - Rédaction SNP

rappel : pour avoir le texte en français choisir une autre langue, n’importe laquelle et revenir au français.

Expression profiling, phylogenetic, and structural analyses of a laccase gene from the red palm weevil, Rhynchophorus ferrugineus

Babiker M. A. Abdel-Banat

Hamadttu A. F. El-Shafie

 

 Article Number - BB697EC62233 Vol.18(31), pp. 978-990, November 2019 https://doi.org/10.5897/AJB2018.16860

 Received : 14 May 2019 Accepted : 18 September 2019 Published : 30 November 2019


 Copyright © 2019 Author(s) retain the copyright of this article.
 This article is published under the terms of the Creative Commons Attribution License 4.0.

 Abstract References How to Cite this Article Authors Article Metrics Full-Text (PDF)

Abstract

Laccases, member of multicopper oxidase (MCO) family enzymes, play crucial roles in insects’ cuticle tanning and pigmentation. The purpose of this study was to identify and characterize a laccase gene from the red palm weevil (RPW), Rhynchophorus ferrugineus. The isolated RPW laccase gene sequence was 3,389 bp, including a 2,163 bp open reading frame that encodes 720 amino acids. The RPW laccase gene conserved the MCO functional motifs Type-3, Type-1, and Type-2, respectively. Phylogenetic analysis categorized this protein into the functional cluster 2 of insect laccases (Lac2). The primary transcripts for R. ferrugineus laccase 2 (RfeLac2) were highly expressed in the adult’s cuticle, elytra, and hindwings, and in the larval cuticles four days before molting. Then, the transcripts were declined drastically in the larval cuticles three days before molting. This implies that the suppression of RfeLac2 in the larvae occurs earlier than expected. RfeLac2 transcripts were very low in the gut and adipose tissues of larvae and adults, irrespective to the span to undergo molting. This suggests that RfeLac2 is not active in the tissues that do not undergo heavy sclerotization. Three-dimensional (3-D) structure modeling of RfeLac2 predicted eight histidines, one glycine, and one phenylalanine, as copper-binding ligands on the laccase active center. The study finding indicates that the pattern of the RPW RfeLac2 expression varies from other coleopteran insects, a phenomenon that requires further investigation.

Key words : Cuticle, expression, laccase, phylogeny, Red palm weevil.

Derniers articles

27 juin, par Rédaction SNP

Ça se précise au niveau du génome (CRP)

This genome will be a valuable resource to understand insect evolution and behavior il and to allow the genetic modification of key genes that will help control this pest.
La recherche se poursuit à l’étranger et il ne se (...)

27 juin, par Rédaction SNP

M2 LS encore ! production de formulation micro-encapsulée

M2i, la PME installée à Parnac, dans le Lot, spécialiste des solutions alternatives aux pesticides à base de phéromones, a officiellement démarré la première unité industrielle au monde de microencapsulation de phéromones.
La micro (...)

27 juin, par Rédaction SNP

Sébastien Abis (chronique)

Sébastien Abis est directeur du Club Déméter et chercheur associé à l’Institut de relations internationales et stratégiques (Iris). Il est aussi codirecteur de l’ouvrage annuel Le Déméter, qui explore les grandes thématiques (...)

Edito

Edito d’avril & mai 2020

13 juin, par Rédaction SNP

Chers amis et passionnés du palmier,
Interrompu par le Covid et autres nous reprenons la série des éditos. Nous avons continué au rythme de l’actualité à tenir notre rubrique "veille documentaire", mais notre activité de communication qui s’exerce par notre présence et participation à des réunions ou des colloques sur le sujet a été forcément, inexistante. Nous aurions pu être sollicités en tant que conseil par des communes désireuses de maintenir (...)